Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc84Q4VA36 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc84Q4VA36 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms