Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ckap2Q3V1H1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ckap2Q3V1H1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms