Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hipk4Q3V016 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hipk4Q3V016 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms