Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed1Q3V009 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed1Q3V009 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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