Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc55Q3UY51 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc55Q3UY51 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc55Q3UY51 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms