Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc114Q3UX62 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc114Q3UX62 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc114Q3UX62 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc114Q3UX62 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms