Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn13Q3UW68 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn13Q3UW68 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn13Q3UW68 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms