Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr1d1Q3UV55 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr1d1Q3UV55 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms