Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trat1Q3UU67 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trat1Q3UU67 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms