Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim15Q3UTD9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smim15Q3UTD9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smim15Q3UTD9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms