Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mindy4Q3UQI9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mindy4Q3UQI9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mindy4Q3UQI9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms