Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cobll1Q3UMF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cobll1Q3UMF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cobll1Q3UMF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms