Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc4Q3UMB9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Washc4Q3UMB9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Washc4Q3UMB9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Washc4Q3UMB9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms