Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpr55Q3UJF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpr55Q3UJF0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpr55Q3UJF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms