Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UJC8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Q3UJC8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UJC8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Q3UJC8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Q3UJC8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms