Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Eif3j1Q3UGC7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eif3j1Q3UGC7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eif3j1Q3UGC7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms