Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rsph3aQ3UFY4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3aQ3UFY4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3aQ3UFY4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms