Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnf180Q3U827 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf180Q3U827 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf180Q3U827 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf180Q3U827 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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