Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tatdn3Q3U1C6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tatdn3Q3U1C6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tatdn3Q3U1C6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms