Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc174Q3U155 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc174Q3U155 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc174Q3U155 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms