Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem35bQ3U0Y2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem35bQ3U0Y2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem35bQ3U0Y2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms