Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hhla1Q3TYV2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hhla1Q3TYV2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hhla1Q3TYV2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms