Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm2Q3TWN3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnnm2Q3TWN3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnnm2Q3TWN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms