Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccndbp1Q3TVC7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccndbp1Q3TVC7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms