Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cwc27Q3TKY6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cwc27Q3TKY6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cwc27Q3TKY6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc27Q3TKY6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc27Q3TKY6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc27Q3TKY6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc27Q3TKY6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc27Q3TKY6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms