Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Jmjd8Q3TA59 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Jmjd8Q3TA59 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Jmjd8Q3TA59 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms