Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim71Q1PSW8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim71Q1PSW8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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