Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cd300lgQ1ERP8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cd300lgQ1ERP8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300lgQ1ERP8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300lgQ1ERP8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300lgQ1ERP8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cd300lgQ1ERP8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lgQ1ERP8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lgQ1ERP8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cd300lgQ1ERP8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms