Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spatc1Q148B6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Spatc1Q148B6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Spatc1Q148B6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Spatc1Q148B6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Spatc1Q148B6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Spatc1Q148B6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Spatc1Q148B6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Spatc1Q148B6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spatc1Q148B6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spatc1Q148B6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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