Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col19a1Q0VF58 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col19a1Q0VF58 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col19a1Q0VF58 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms