Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd12Q0VE29 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd12Q0VE29 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Samd12Q0VE29 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samd12Q0VE29 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms