Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lrriq1Q0P5X1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lrriq1Q0P5X1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lrriq1Q0P5X1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lrriq1Q0P5X1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms