Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Vps8Q0P5W1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Vps8Q0P5W1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vps8Q0P5W1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Vps8Q0P5W1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms