Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib3Q0P523 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cib3Q0P523 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms