Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cnnm1Q0GA42 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnnm1Q0GA42 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnnm1Q0GA42 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cnnm1Q0GA42 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnnm1Q0GA42 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnnm1Q0GA42 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnnm1Q0GA42 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnnm1Q0GA42 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnnm1Q0GA42 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnnm1Q0GA42 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cnnm1Q0GA42 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms