Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cass4Q08EC4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cass4Q08EC4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cass4Q08EC4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms