Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgm3Q08189 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tgm3Q08189 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tgm3Q08189 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms