Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col9a2Q07643 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col9a2Q07643 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col9a2Q07643 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms