Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdx4Q07424 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx4Q07424 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms