Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nfe2Q07279 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nfe2Q07279 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nfe2Q07279 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms