Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1bQ06985 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1bQ06985 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Siah1bQ06985 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms