Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sox13Q04891 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox13Q04891 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms