Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col6a1Q04857 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col6a1Q04857 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col6a1Q04857 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a1Q04857 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a1Q04857 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a1Q04857 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a1Q04857 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 455.2 ms