Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd1Q04519 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Smpd1Q04519 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpd1Q04519 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms