Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msx2Q03358 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Msx2Q03358 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msx2Q03358 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms