Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfiaQ02780 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NfiaQ02780 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfiaQ02780 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms