Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pax5Q02650 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax5Q02650 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms