Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ctnnb1Q02248 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctnnb1Q02248 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctnnb1Q02248 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctnnb1Q02248 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms