Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd1Q02242 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd1Q02242 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd1Q02242 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms