Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Snai1Q02085 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snai1Q02085 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snai1Q02085 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms